郭氏平乐正骨已有二百余年行医史，清代时医过慈禧太后，德高医精，闻名遐迩。郭家一直人丁不旺,到第四代传人郭一山,娶了两房夫人都相继去世,只留下一个小女儿。为传宗接代,让郭氏正骨代代相传,郭一山又急急迎娶小他十一岁的山村姑娘云鹤鸣。迎亲路上,新娘坐轿,新郎骑马,乐班子吹吹打打,一路热闹。突然有人抬着担架拦住了迎亲队伍,原来是意大利传教士马利奇大腿受伤,急切赶来,拦路求医。虽然民间讲究迎亲队伍不能中途停止,否则,往后的日子会风波不断,但郭一山还是下马救人。
《特别使命》是一部描写高智商犯罪的电视剧，该剧有别于其他涉案剧。近年来电视银屏所播出的涉案剧都是以刑事案件为主，例如《重案六组》、《案发现场》等等；然而《特别使命》是围绕“税”这个社会焦点话题来描写的，这无疑是众多涉案影视作品中的一个新的亮点。
二○年代的香港贪污盛行，苦力李长旺（万梓良饰）为了改善一家生活，不惜举债买得消防员一职。热心的长旺因出手相助黄水（林嘉华饰）、黄山（林文龙饰）兄弟，得罪上司陈波（戴志卫饰），陈波友人周金荣（罗乐林饰）设计将长旺卖往南洋，长旺妻子袁秀兰（米雪饰）奔走营救，无奈势单力薄，最后只得携子寻夫。长旺卖到印尼锡矿场为奴，不断脱逃，最后一次逃走时结识老板之女若楠（罗霖饰）。长旺觉悟逃脱困难，决安心等待期满。另方面若楠见猪仔困苦，说服长旺筹办工运，结果遭荷兰兵镇压造成死伤，若楠带走家产偕众人离开印尼。若楠经此番甘苦与长旺互生好感，唯长旺念念不忘妻子家人，始终视若楠为红颜知己。两人与黄山兄弟返港投资获利，不断捐款，改善猪仔生活，而黄水因贪图富贵大表不满，最后与两人反目成仇。当年秀兰寻夫流落异乡又染重病，幸得富商雷星辉（王伟饰）照顾，更为恩情与孩子们着想而改嫁。在港与长旺重遇时愧疚不敢相认，仅暗中助其逃过黄水追杀，但水紧追不舍，不但迫害黄山与其妻小燕（郭可盈饰），更将长旺逼进绝境。若楠舍命相救，长旺痛心不已向若楠求婚，遭婉拒。楠逝世，至死也无缘与所爱的人结合。长旺对秀兰与孩子们仍苦苦相求，秀兰面对恩与爱的两难，不知如何是好？雷星辉可愿将心爱女子拱手而还？此外，恶人黄水终逃不过上天制裁，死在黄山枪下。黄山判刑二十五年，小燕一往情深，默默守候.....。
身为警察的秦枫和一步步成为汉洲当地最大犯罪头目的刘天也，情同手足却又代表着黑白两极，以龙湾村附近汉洲港开发为大背景，秦枫破案为契机，逐渐搅动起几方利益集团的明争暗斗。经过数年间与当地犯罪分子斗智斗勇，最终将多起案件逐一告破的故事。
周自瑜（胡杏儿 饰）为了与男友应海亮日日相伴而专门转换工作到广告公司上班，在路上拾到流浪狗小巴后不舍将它遗弃，在海亮的建议下安置在邻居的院子里。苗准（罗嘉良 饰）为人专横暴躁，最痛恨流浪狗。偏偏他就搬进了自瑜隔壁。一见到小巴他就要把它赶走。自瑜为了保住小巴，力争让小巴成为广告“男主角”，苗准不得不为这个“男主角”天天服侍。自瑜家里原本有一个狗场，谁知因为她带回的流浪狗大巴患病，导致狼狗死亡狗场关闭，令父亲耿耿于怀，更加入打狗队来惩治流浪狗；而兄嫂也只能转开宠物店来维持生计。而苗准则是因为女友因为救大巴而遭遇车祸，他把所有的爱都转嫁到女友留下的爱猫CanCan身上。自瑜和苗准日日在公司上演“猫狗大战”，却又在对方失落时给予关怀。当自瑜失恋后，苗准开始明白自己的感情。然而猫和狗真的能相恋吗？
人族与妖族皆因受欲望驱使寻找玉醴神泉，数百年来引发各路人马纷争不断。生性洒脱、应变值满点的少女肖瑶，意外开启万妖谷奇幻之旅，将妖界搅的天翻地覆。受万妖敬仰、人族忌惮的万妖之王红烨再次出世守护万妖谷。历遍沧桑的他早已洞察世间万物的本性弱点，深知玉醴泉乃万千欲望的缩影，在相处中逐渐察觉肖瑶不被欲念支配的纯粹之心的可贵。二人携手前行，接连被怪案缠身，遇到了难以对付的神秘对手…
影帝“穆廷州”，是个“母胎solo”的高冷男神，却阴差阳错地在一次意外后“失去记忆”，他认定自己是来自古代的“太傅”，而明薇是他的“公主”，自此对明薇毕恭毕敬又管东管西。男女主的思维交汇不断在古代和现代交错穿插，他们的日常画风也是格外“错乱”，穆廷州会在化身太傅后每日打电话向女主请安：“微臣穆昀，遥拜公主”，也会身着笔挺的西装当着众人的面向女主行跪拜之礼。
学妹袁初雨偶遇曾暗恋的学长梁泽，两人开始了一段充满悸动与热烈的爱情。然而就在爱得浓烈的至高点时，学长不辞而别。多年后再度重逢，学长已改名为白泽，变身为一个稳重、冷感的成熟男人。随着谜团逐渐解开，两人的关系就在推拉中再次碰撞出火花时。一个叫苏晴的女人却突然闯入…
李潇潇和丈夫周明远遭遇创业失败和房产纠纷，导致家庭陷入经济危机，二人与一对新婚夫妻顾易和韩星暂时合租于同一屋檐下，两个家庭的生活交织在一起，状况百出。李潇潇成功面试新公司，却意外与顾易成为同事，在工作上从针锋相对到携手合作，逐渐结成了互相信任的战友。两家人也从相互对立到惺惺相惜，最终结为挚友。李潇潇的工作越来越出色，周明远反而因病失业在家，他在生活的打击下失去自信，因不堪重负向李潇潇提出离婚。刚在事业上稍有起色的李潇潇本想全身心投入工作，却因反对上级裁员而成了第一个被裁的人。求职失败的李潇潇决定跟同样被裁员的顾易等伙伴一起重新创业，他们不断拼搏，终于在激烈的竞争中脱颖而出，李潇潇也找回了自己的爱情。
骊城公安局最年轻的法医齐思哲（罗云熙 饰），因一场车祸失去了女友俞菲，但他发觉意外的背后似乎隐藏着神秘的幕后推手。为了调查真相，齐思哲入职成为河城市公安局的刑侦法医，却被迫卷入一桩桩令人细思极恐的奇诡悬案之中，身亡许久的被害者被重重蛛丝包裹，失踪的尸体出现在标本室的福尔马林中……在侦破过程中，他与祝青越（刘雅瑟 饰），韩烽（江奇霖 饰）强强联合，抽丝剥茧屡破奇案，而牵涉当年俞菲之死的“原钻”毒品案，也逐渐展露冰山一角……
1948年，国共两党的搏杀已经到了最为关键的时刻。国统区政经体制混乱失控，物价飞涨，贪官横行，国民政府的统治早就危如累卵，大厦将倾。与此同时，另一头国民党空军笕桥航校上校教官方孟敖（刘烨 饰）正因违抗军令接受审判。方出身于富庶世家，他是中央银行北平分行经理方步亭（王庆祥 饰）的公子，而另一个身份则是我党潜伏在国军中的地下党员。方经蒋经国干涉，得以免罪转到国防部预备干部局，随后参与“孔雀东南飞”行动调查北平分行的舞弊行为。身处时代的乱流当中，一面有来自国军内部的猜忌和调查，一面有来自同僚的暗算和倾轧，更有战火当前纷繁迭出的险状。方和所有地下工作者们以其赤血丹心铸就了新中国崛起的基石……
1948年，国共两党的抗争已达到白热化阶段，天下大势虽初现端倪，却也恰恰处在极为凶险，丝毫容不得有任何闪失的关键时刻。九月的一天，一名中共地下党员在沪落网并叛变，为求自保其意欲向时任上海国民政府中央情报第八局的局长谭忠恕（林永健 饰）供出一名重要卧底，此举无疑关系着我党革命的成败。谭此前和我党传奇特工水手有过多次交手经历，此番他胜券在握，而一连串的变故令其意识到敌我双方泥潭之凶险。与此同时，谭为了阻止药品大亨庄文清手中的药品落入解放军之手，透过儿子的校长段海平（陆剑民 饰）实施摩西计划；极富野心的第八局行动处长李伯涵在疯狂追查共党卧底的过程中，则将矛头指向谭最信任的总务处处长刘新杰（吴秀波 饰）。你来我往，明枪暗箭，黎明前最凶险的棋局悄悄布开……
二十年代的上海，父母遭人陷害的谢家兄妹三人各自离散，走上不同的人生之路。谢之飞历经坎坷成立了自己的纱厂，他与工人一同工作、奋斗，为工人社会地位的提升做出了贡献，并在纱厂经理徐丰（实则共产党）的鼎力协助下，担任了上海工厂迁移委员会会长，肩负着将上海滩的工厂迁往内地的重任。谢之飞无意中发现，当年害死他双亲的，正是与日本人勾结阻挠内迁的张慎，他为工厂内迁一事与张慎展开激烈的斗争。经过漫长曲折的寻亲之路，谢之飞终于找到了兄长与妹妹。兄长为救谢之飞，死在了张慎的枪口之下，妹妹则加入了共产党，失道寡助的张慎被谢之飞击垮。随后，兄妹二人凝聚起正义的力量，开始与张慎背后更大的恶势力——日本侵略者，展开殊死较量！抗战胜利后，谢之飞将名下全部资产与实业捐献给新中国，兄妹二人来到谢之年墓前，告慰兄长的在天之灵。
